(1)取得事業機構管制編號及密碼。(2)請上網進入環境保護許可管理資訊系統（http://ems.epa.gov.tw/）依系統指示輸入機構管編及密碼資料，再點選右方功能列之「基線資料填報」。(3)點選上方「基線資料填報/確認」並依序填妥下方表格資料。(4)點選「許可申請、變更/異動」-事業廢棄物清理計畫書，系統會自動帶至事業廢棄物清理計畫書介面。(5)依填報內容點選「填報、變更或異動」後，再點選同步EMS資料。(6)輸入完成後，請以預覽列印功能列印出一式二份，裝訂後於每頁之間加蓋騎縫章。(7)請於清理計畫書八、用印欄欄位中用印，其「專責人員簽章」處，若非屬環境部公告應設置專責人員之事業，則毋需於專責人員簽章處簽章。(8)請檢附工廠登記證、營業登記證明文件或其他相關設立證明文件影本，並於其上加蓋公司章，註明與『正本相符』。(9)繳交清理計畫書審查費請以「現金」或郵政匯票（受領人請開立：臺北市政府環境保護局）繳付。(10)清理計畫書請寄送臺北市政府環境保護局收（11008臺北市信義區市府路1號6樓）。(11)提報事業廢棄物清理計畫書若有任何疑義，請洽環境部資源循環署（電話0800059777）或環保局廢棄物處理管理科（電話27208889轉7294）。
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